Atyánszky György volt az első olyan aktív képviselő a rendszerváltás utáni parlamentek történetében, akit csődbűntett elkövetésével vádoltak. Mivel Torgyán József védelmébe vette, mentelmi jogának felfüggesztése ellenére is a kisgazdafrakció tagja maradhatott. Az ellene indult eljárás kapcsán csak annyit mondott: vágóhídra küldték a pártot.
1999 szeptemberében a martfűi pékség vagyontárgyainak kivonása miatt kezdeményezte az ügyészség az eljárás megindítását. A bíróság első fokon nyolc hónap felfüggesztett szabadságvesztésre ítélte, amit másodfokú határozatában pénzbüntetésre mérsékelt. A közügyek gyakorlásától nem tiltották el.
Több parlamenti munkacsoport, például a gazdasági, illetve a honvédelmi bizottság munkájában is részt vett. 2001 szeptemberében kiemelte a Honvédelmi Minisztérium és a honvéd vezérkar szervezeti különállásának fontosságát, hogy két egymást ellenőrző testület alkothassa a honvédség gerincét. 2000 decemberében a szerződéses állomány létrejöttét a haderőreform fontos részeként említette parlamenti felszólalásában, ugyanakkor a sorkötelezettség megszüntetését időszerűtlennek nevezte.
1998 szeptemberében a hadirokkantaknak, hadiárváknak és hadiözvegyeknek járó állami támogatás egy összegben történő kifizetését szorgalmazta. 2000 augusztusában az olajügyek kapcsán a közélet tisztaságának megőrzésére szólította fel a parlamentet, igaz, negyed évvel később Sándor István („Papa”) vallomásában Atyánszky nevét is megemlítette az olajügyekkel kapcsolatban.
A Torgyán József egyik fő támogatójaként számon tartott politikus 2001 szeptemberében követve a kizárt pártelnököt kilépett a kisgazdafrakcióból, átült a függetlenek közé, és ellenzékbe vonult. Azóta néma maradt a parlament ülésein.
1971-92 között a Gabonaforgalmi és Malomipari Vállalat munkatársaként dolgozott. 1993 óta a hajósi mezőgazdasági kombinát kereskedelmi igazgatója. 1993-97-ig a Vállalkozók Országos Szövetségének elnökségi tagja volt, 1993-95-ben pedig a Köztársaság Párt elnökségének volt tagja. 1995-től Torgyán József és az FKGP főtanácsadója volt.
Atyánszky György a sorkötelezettség fontosságáról: Ugyanakkor arra is szeretném ráirányítani a figyelmet, hogy képviselőtársaim helyesen mutattak rá a sorkatonai szolgálatkötelezettség egyéb összetevőjére is, így a fiatalság hazafias nevelésében, a hazaszeretetben, a nemzet védelmében betöltött szerepére egyaránt.