ózon Creative Commons License 2008.02.09 0 0 785

"a "jelentős hányada azonos vagy hasonló..." kitétel picikét túlzás... elég lett volna a hasonló, az olyan ködös, bármire rá lehet húzni...ha valaki mond egyetlenegy olyan gént, amely azonos az emberben és bármely (szabadon választott) baciban, az nagyon nagy dícséretet kap!"

 

Egy emberi és egy mikroba gén több szempontból (funkció, eredet, szerkezet, v. mindegyik, stb.) lehet azonos. Ebben az esetben nyilván nem a teljes azonosságról van szó, ami az evolucióval kapcsolatban elég visszás is lenne, mivel az evolució változásokon keresztül valósul meg. Éppen változásokból eredő különbség mértékéből lehet következtetni a rokonság fokára. A rokon gének közötti hasonlóság a mutációk ellenére, tagadhatatlan. Másolok ide ötletszerűen néhány emberi és máshonnan származó párt, nézd meg magad, hogy a hasonlóság olyan-e, hogy "azt bármire rá lehet húzni"! Ezek itt ember-tamarin, ember-selyemhernyó és ember-primitiv gomba géneknek a sejt által lefordított fehérje változatai. Ilyen formában kevesebb helyet foglalnak el, mint a DNS kódjuk leírva. Ezek elég konzervativ gének, de tízezer számra találhatsz másikakat is az egyre növekvő adatbázisokban. Küldhetek linkeket, és ha zavaros, szívesen segítek az értelmezésben.  

Remélem, csökkennek a kétségeid!

sp Q9N1U2
HSP76_SAGOE Heat shock 70 kDa protein 6 (Hsp-70-related intracellular vitamin
D-binding protein) [HSPA6] [Saguinus oedipus (Cotton-top
tamarin)]
643 AA
align Score = 624 bits (1610), Expect = e-177 Identities = 320/341 (93%), Positives = 327/341 (95%) Query: 1 MQAPRELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQ 60 MQAPRELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQ Sbjct: 1 MQAPRELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQ 60 Query: 61 AALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFQVVSEGGKPKVRVCYRGEDKTFYPEE 120 AALNP NTVFDAKRLIGRKFAD TVQ+DMKHWPFQVVSEG KPKVRV YRGEDK+FYPEE Sbjct: 61 AALNPLNTVFDAKRLIGRKFADATVQADMKHWPFQVVSEGCKPKVRVSYRGEDKSFYPEE 120 Query: 121 ISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPTYFSNSQRQATKDAGAIAGLKVLPIINEATA 180 ISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVP YF++SQRQATKDAGAIAGL VL IINE TA Sbjct: 121 ISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTA 180 Query: 181 AAIAYGLDRRGAGKRNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLV 240 AAIA+GLDRRGAG+RNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLV Sbjct: 181 AAIAHGLDRRGAGERNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLV 240 Query: 241 NHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAKRTPSSSTQATLEIDSLFEGVDFYKSIT 300 NHF+EEFRRKH KDLS NKRALRRLRTACERAKRT SSSTQATLEIDSLFEGVDFY SIT Sbjct: 241 NHFVEEFRRKHRKDLSWNKRALRRLRTACERAKRTLSSSTQATLEIDSLFEGVDFYTSIT 300

Query: 301

RARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDFVLGGG 341 RARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHD VL GG Sbjct: 301 RARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDVVLVGG 341

 

Q9N1U2 HSP76_SAGOEHeat shock 70 kDa protein 6 (Hsp-70-related intracellular vitamin
D-binding protein) [HSPA6] [Saguinus oedipus (Cotton-top
tamarin)]
643 AA 
Score = 624 bits (1610), Expect = e-177 Identities = 320/341 (93%), Positives = 327/341 (95%) Query: 1 MQAPRELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQ 60 MQAPRELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQ Sbjct: 1 MQAPRELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQ 60 Query: 61 AALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFQVVSEGGKPKVRVCYRGEDKTFYPEE 120 AALNP NTVFDAKRLIGRKFAD TVQ+DMKHWPFQVVSEG KPKVRV YRGEDK+FYPEE Sbjct: 61 AALNPLNTVFDAKRLIGRKFADATVQADMKHWPFQVVSEGCKPKVRVSYRGEDKSFYPEE 120 Query: 121 ISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPTYFSNSQRQATKDAGAIAGLKVLPIINEATA 180 ISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVP YF++SQRQATKDAGAIAGL VL IINE TA Sbjct: 121 ISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTA 180 Query: 181 AAIAYGLDRRGAGKRNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLV 240 AAIA+GLDRRGAG+RNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLV Sbjc 181 AAIAHGLDRRGAGERNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLV 240 Query: 241 NHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAKRTPSSSTQATLEIDSLFEGVDFYKSIT 300 NHF+EEFRRKH KDLS NKRALRRLRTACERAKRT SSSTQATLEIDSLFEGVDFY SIT Sbjct: 241 NHFVEEFRRKHRKDLSWNKRALRRLRTACERAKRTLSSSTQATLEIDSLFEGVDFYTSIT 300 Query: 301

RARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDFVLGGG 341 RARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHD VL GG Sbjct: 301 RARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDVVLVGG 341

 

 

Q8N0P2_BOMMOHeat shock cognate protein [BmHSC70-4] [Bombyx mori (Silk moth)]649 AA
Score = 562 bits (1448), Expect = e-158 Identities = 271/334 (81%), Positives = 314/334 (94%) Query: 8 AVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQAALNPHN 67 AVGIDLGTTYSCVGVFQ G+VEI+ANDQGNRTTPSYVAFTDTERL+GDAAK+Q A+NP+N Sbjct: 6 AVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPNN 65 Query: 68 TVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFQVVSEGGKPKVRVCYRGEDKTFYPEEISSMVLS 127 T+FDAKRLIGRKF D TVQ+DMKHWPF+VVS+GGKPK++V Y+GEDKTF+PEE+SSMVL+  66 TIFDAKRLIGRKFEDATVQADMKHWPFEVVSDGGKPKIKVAYKGEDKTFFPEEVSSMVLT 125 Query: 128 KMKETAEAYLGQPVKHAVITVPTYFSNSQRQATKDAGAIAGLKVLPIINEATAAAIAYGL 187 KMKETAEAYLG+ V++AVITVP YF++SQRQATKDAG I+GL VL IINE TAAAIAYGL Sbjct: 126 KMKETAEAYLGKTVQNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTISGLNVLRIINEPTAAAIAYGL 185 Query: 188 DRRGAGKRNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFMEEF 247 D++G G+RNVLIFDLGGGTFDVS+L+I+ G+FEVK+TAGDTHLGGEDFDNR+VNHF++EF 186

DKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFVQEF 245 Query: 248 RRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAKRTPSSSTQATLEIDSLFEGVDFYKSITRARFEEL 307

+RK+ KDL+ NKRALRRLRTACERAKRT SSSTQA++EIDSLFEG+DFY SITRARFEEL Sbjct: 246 KRKYKKDLATNKRALRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLFEGIDFYTSITRARFEEL 305

Query: 308

CSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDFVLGGG 341 +DLFRST+EPVEK+LRDAK+DKAQIHD VL GG Sbjct: 306 NADLFRSTMEPVEKSLRDAKMDKAQIHDIVLVGG 339

 

Q53H23_HUMANHeat shock 70kDa protein 9B variant (Fragment) [Homo sapiens
(Human)]
679 AA
Score = 775 bits (2002), Expect = 0.0 Identities = 391/622 (62%), Positives = 486/622 (78%), Gaps = 9/622 (1%) Query: 16 SFRIATRLQ--STKVQGSVIGIDLGTTNSAVAIMEGKVPKIIENAEGSRTTPSVVAFTKE 73 +FR+ +R S ++G+V+GIDLGTTNS VA+MEGK K++ENAEG+RTTPSVVAFT + Sbjct: 37 AFRLVSRRDYASEAIKGAVVGIDLGTTNSCVAVMEGKQAKVLENAEGARTTPSVVAFTAD 96 Query: 74 GERLVGIPAKRQAVVNPENTLFATKRLIGRRFEDAEVQRDIKQVPYKIVKHSNGDAWVEA 133 GERLVG+PAKRQAV NP NT +ATKRLIGRR++D EVQ+DIK VP+KIV+ SNGDAWVEA Sbjct: 97 GERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYATKRLIGRRYDDPEVQKDIKNVPFKIVRASNGDAWVEA 156 Query: 134 RGQTYSPAQIGGFVLNKMKETAEAYLGKPVKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGQIVGLNV 193 G+ YSP+QIG FVL KMKETAE YLG KNAV+TVPAYFNDSQRQATKDAGQI GLNV Sbjct: 157 HGKLYSPSQIGAFVLMKMKETAENYLGHTAKNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGQISGLNV 216 Query: 194 LRVVNEPTAAALAYGLEKSDSKVVAVFDLGGGTFDISILDIDNGVFEVKSTNGDTHLGGE 253 LRV+NEPTAAALAYGL+KS+ KV+AV+DLGGG FDISIL+I GVFEVKSTNGDT LGGE Sbjct: 217 LRVINEPTAAALAYGLDKSEDKVIAVYDLGGGAFDISILEIQKGVFEVKSTNGDTFLGGE 276 Query: 254

DFDIYLLREIVSRFKTETGIDLENDRMAIQRIREAAEKAKIELSSTVSTEINLPFITADA 313 DFD LLR IV FK ETG+DL D MA+QR+REAAEKAK ELSS+V T+INLP++T D+ Sbjct: 277 DFDQALLRHIVKEFKRETGVDLTKDNMALQRVREAAEKAKCELSSSVQTDINLPYLTMDS 336 Query: 314 SGPKHINMKFSRAQFETLTAPLVKRTVDPVKKALKDAGLSTSDISEVLLVGGMSRMPKVV 373 SGPKH+NMK +RAQFE + L++RT+ P +KA++DA +S SDI EV+ VGGM+RMPKV Sbjct: 337 SGPKHLNMKLTRAQFEGIVTDLIRRTIAPCQKAMQDAEVSKSDIGEVIPVGGMTRMPKVQ 396 Query: 374 ETVKSLFGKDPSKAVNPDEXXXXXXXXXXXXLSGEXXXXXXXXXXPLSLGIETLGGVFTR 433 +TV+ LFG+ PSKAVNPDE L+G+ PLSLGIETLGGVFT+ Sbjct: 397 QTVQDLFGRAPSKAVNPDEAVAIGAAIQGGVLAGDVTDVLLLDVTPLSLGIETLGGVFTK 456 Query: 434 LIPRNTTIPTKKSQIFSTAAAGQTSVEIRVFQGERELVRDNKLIGNFTLAGIPPAPKGVP 493 LI RNTTIPTKKSQ+FSTAA GQT VEI+V QGERE+ DNKL+G FTL GIPPAP+GVP Sbjct: 457 LINRNTTIPTKKSQVFSTAADGQTQVEIKVCQGEREMAGDNKLLGQFTLIGIPPAPRGVP 516 Query: 494 QIEVTFDIDADGIINVSARDKATNKDSSITVAGSSGLSENEIEQMVNDAEKFKSQDEARK 553 QIEVTFDIDA+GI++VSA+DK T ++ I + S GLS+++IE MV +AEK+ +D +K Sbjct: 517 QIEVTFDIDANGIVHVSAKDKGTGREQQIVIQSSGGLSKDDIENMVKNAEKYAEEDRRKK 576 Query: 554 QAIETANKADQLANDTENSLKEFEGKVDKAEAQKVRDQITSLKELVAR--VQGGEEVNAX 611 + +E N A+ + +DTE ++EF+ ++ E K++++I+ ++EL+AR + GE + Sbjc577 ERVEAVNMAEGIIHDTETKMEEFKDQLPADECNKLKEEISKMRELLARKDSETGENIR-- 634 Query: 612

XXXXXXXXXQTSSMKLFEQLYK 633

 Q +S+KLFE YK Sbjct: 635

---QAASSLQQASLKLFEMAYK 653

Előzmény: Törölt nick (599)