FAT32-n nincsenek jogosultságok. Lehet, hogy a filekezelőben látsz jogokat, de az csak azért van, hogy legyen valami odaírva.
Nem tudom, hogyan gondoltad a telepítő lementését, de ha akarod, azt a partíciót is átalakíthatod. Persze akkor a rajta levő adatok elvesznek.