ez nem php-s kerdes az teny, igy kerdes milyen adatbazisod van? A powerdesigner, vagy 30 napos demoja is eleg sokfelet tud, igaz erteni kell magahoz az adatbazishoz mert van hogy teved. De ha megmondod milyen adatbazishoz kell, talan konnyebb ajanlani is.
http://www.sybase.com/products/enterprisemodeling/powerdesigner
A Visio meg nem pont ilyenre valo :)