Aha... Kezd tisztulni a dolog.
Ahhoz, hogy az apache-csal együttműködjön, vagy a --apache vagy a --apxs kapcsolót kell használni. Előbbit nem tudom, hogy működik, utóbbi apache modulként készíti el a php környezetet és berakja az apache megfelelő könyvtárába. Ha nincs a PATH-ban az apxs nevű program, akkor a --apxs=/utvonal/apxs formaban meg kell adni.