A műtrágyák kezelésének és tárolásának helyéül szolgáló épületeket és területetek megfelelően kell biztosítani annak érdekében, hogy az illetéktelen személyeket távol lehessen tartani. Az ammónium-nitrátot vagy egyéb nitrátokat tartalmazó műtrágyákat robbanószer gyártására is fel lehet használni, amire már láttunk példát több terrortámadás kapcsán is világszerte.