"az a legjobb megoldás, ha az egyik ventilátor aktuális fordulatszámát nem a másik ventilátoré határozza meg, hanem pl egy légnyomás különbség."

Természetesen. A fordszám-kimenetről csak az aktuális fordulatszámot olvasod ki, hogy összehasonlíthasd a tényleges fordszámot a megkívánttal. Aztán már olyan fordulatszámot állítasz be a ventinek, amilyet akarsz. 

A légnyomás-különbség mérésére milyen olcsó eszközök vannak? Persze olyanra gondolok, amely valamilyen elektromos jelet ad ki.